Schon in mehreren Jahren hat der FC Magdeburg im DFB-Pokal gegen verschiedene Erst- und Zweitligisten spielen dürfen.

Hier eine Übersicht aller DFB-Pokal-Teilnahmen:

1993/1994

24.08.1993 1. FC Magdeburg - Wuppertaler SV 8:7
11.09.1993 1. FC Magdeburg - Bayer Leverkusen 1:5

1998/1999

29.08.1998 1. FC Magdeburg - KFC Uerdingen 1:2

2000/2001

27.08.2000 1. FC Magdeburg - 1. FC Köln 5:2
01.11.2000 1. FC Magdeburg - Bayern München 5:3
28.11.2000 1. FC Magdeburg - Karlsruher SC 5:3
20.12.2000 1. FC Magdeburg - Schalke 04 0:1

2001/2002

26.08.2001 1. FC Magdeburg - VfL Wolfsburg 1:5

2003/2004

31.08.2003 1. FC Magdeburg - MSV Duisburg 3:4

2006/2007

09.09.2006 1. FC Magdeburg - SC Paderborn 07 7:8

2007/2008

04.08.2007 1. FC Magdeburg - Borussia Dortmund 1:4

2009/2010

01.08.2009 1. FC Magdeburg - Energie Cottbus 1:3

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